北京孔庙和国子监博物馆是由过去的孔庙和国子监“左庙右学”合并而成的博物馆。2008年6月14日，北京孔庙和国子监博物馆正式开馆，对外开放。
国子监
国子监始建于13世纪的元朝(1287年)，是元、明、清三代国家管理教育的行政机关和最高学府，至今已有7百多年历史。北京国子监坐落在北京东城区安定门内国子监街（原名成贤街）15号，与孔庙相邻。国子监整体建筑坐北朝南，中轴线上分布着集贤门（大门）、太学门（二门）、琉璃牌坊、辟雍、彝伦堂、敬一亭。东西两侧有四厅六堂，构成传统的对称格局，是我国现存唯一一所古代中央公办大学建筑。 国子监街是北京城唯一保存四座牌楼的古巷。
主要建筑
集贤门是国子监的大门，门内院子东西设有井亭，东侧的持敬门
辟雍
与孔庙相通。 进入国子监的第二门—太学门，就是国子监的第二进院落，里面有琉璃牌坊， 辟雍和彝伦堂。
国子监牌楼
琉璃牌坊
走过太学门，就是国子监二门内大型琉璃坊牌坊，它是北京唯一一座专门为教育而设立的牌坊。正反两面横额均为皇帝御题，是中国古代崇文重教的象征。位于集贤门内，是三间四柱七楼庑殿顶式琉璃牌坊，乾隆四十八年（1783年）。正面额书“圜桥教泽”，阴面为"学海节观"，彩画华美，是北京唯一不属于寺院的琉璃牌坊。
辟雍
国子监辟雍是国子监的中心建筑，建于中轴线中心一座圆形水池中央的四方高台上，是一座方型重檐攒尖顶殿宇。四面开门，设台阶六级。辟雍周围环绕著长廊，四面架设精致的小桥横跨水池使殿宇与院落相通，这种建筑形制象征着天圆地方。乾隆皇帝之后，每逢新帝即位，都要来此做一次讲学，以示中央政府对高等教育的重视。 六堂是位於辟雍左右两侧的33间房，合称为六堂，分别为：率性堂、诚心堂、崇志堂、修道堂、正义堂、广业堂，是贡生、监生们的教室。
彝伦堂
彝伦堂位于辟雍大殿以北，元代名为崇文阁，明代永乐年间予以重建并改名为彝伦堂，早年曾是皇帝讲学之处，兴建辟雍之后，则改为监内的藏书处。
敬一亭
敬一亭位于在彝伦堂之後，是国子监的第三进院落。建于明嘉靖七年，设有祭酒厢房和司业厢房和七座御制圣谕碑，是国子监祭酒办公的场所。 在孔庙与国子监之间的夹道内，有一处由189座高大石碑组成的碑林。石碑上篆刻着儒家经典：《周易》、《尚书》、《诗经》、《周礼》、《仪礼》、《礼记》、《春秋左传》、《春秋公羊传》、《春秋谷梁传》、《论语》、《孝经》、《孟子》、《尔雅》。这部石经的蓝本是雍正年间的江苏金坛贡生蒋衡历时12年手书而成。乾隆五十六年（公元1791年）下旨刻石立碑。全部石经共计63万余字，规模宏大，楷法工整，内容的准确性和刻制的精美度都优于西安的“开成石经”，而在规模上也是仅次于西安碑林的全国第二大碑林。相传乾隆命和珅、王杰为总裁，彭元瑞、刘墉为副总裁来考订经稿。彭元瑞以宋元善本十三经核订蒋衡手书的经稿，并把俗体字均改为古体字，使经文更加完善规范，古意大增，受到乾隆赞赏，被授以太子太保衔。这使和珅嫉恨非凡，权倾朝野的他命人在一夜之间挖去石碑上全部改过的古体字。直到和珅垮台后，古体字迹才得以重新修复，至今碑面上还有一块块挖补的痕迹 国子监第一任祭酒是元代著名理学家许衡，当时有学生200余人。在这里学习的学生叫“监生”，大致有三种来源：一是从全国各地秀才中选拔的正途监生，到此作进一步深造；二是外国留学生，大致来自高丽、逞逻、交趾、俄罗斯等；三是“捐监”，挂名监生，只要交足银子，就能领取“监照”，算是监生。
北京孔庙
北京孔庙始建于元大德六年(1302)，大德十年建成(1306)。历代多次重修，为元、明、清三代祭孔建筑，又名"先师庙"。庙坐北朝南，大门称先师门，仍保持元代风格。
孔庙大成门北京孔庙主体建筑都覆以黄色琉璃瓦，是封建社会的最高建筑规制。整座孔庙建筑布局科学，规模宏大，凸显皇家气派。北京孔庙与其他地方的不同，因为它有碑林，其实就是一部石刻的功名簿。元、明、清三代的读书人，凡中了举人的就在此立一块石碑，“一举成名天下闻”。
孔庙大成殿
先师门（又称棂星门）是孔庙的大门，面阔三间，进深七檩，单檐歇山顶，基本上保留了元代的建筑风格，先师门两侧连接庙宇的外围墙，犹如一座城门。进入先师门，迎面看到的便是大成门。大成门创建于元代，清代重修，面阔五间，进深九檩，单檐歇山顶。整座建筑坐落在高大的砖石台基上，中间的御路石上高浮雕海水龙纹图样，五龙戏珠，栩栩如生。大成门前廊两侧摆放着10枚石鼓，每枚石鼓的鼓面上都篆刻一首上古游猎诗。这是清乾隆时仿公元前8世纪周宣王时代的石鼓遗物刻制的，那难辨的文字和深邃的诗意恐怕只有学识渊博的孔老夫子才能完全理解吧。第一进院落是皇帝祭孔前筹备各项事宜的场所，其东侧设有宰牲亭、井亭、神厨，用于祭孔三牲的宰杀、清洗和烹制。两侧有神库、致斋所用于祭孔礼器的存放和供品的备制。
第二进院落是孔庙的中心院落，每逢祭孔大典，这里便钟鼓齐鸣，乐舞升平，仪仗威严。大成殿是第二进院落的主体建筑，也是整座孔庙的中心建筑，是孔庙内最神圣的殿堂。大成殿始建于大德六年（公元1302年），后毁于战火，明永乐九年（公元1411年）重建，清光绪三十二年（公元1906年）将殿由7间扩建为9间。殿内金砖铺地，内顶施团龙井口天花，其规制是中国封建社会的最高建筑等级，堪与故宫太和殿媲美。殿中供奉孔子“大成至圣文宣王”木牌位，神位两边设有配享的“四配十二哲”牌位。神位前置祭案，上设尊、爵、卣、笾、豆等祭器均为清乾隆时的御制真品。大殿内外高悬清康熙至宣统9位皇帝的御匾，均是皇帝亲书的对孔子的四字赞语，是珍贵的文物。
孔庙奉祀人物孔庙的第三进院落最具特色，由崇圣门、崇圣殿和东西配殿组成独立完整的院落，与前二进院落分割明显而又过渡自然，反映出古人在建筑部局上的巧妙构思。这组建筑称为崇圣祠，是祭祀孔子五代先祖的家庙。建于明嘉靖九年（公元1530年），清乾隆二年（公元1737年）重修，并将灰瓦顶改为绿琉璃瓦顶。崇圣殿又称五代祠，面阔五间，进深七檩，殿前建有宽大的月台，月台三面建有垂带踏步各十级。殿内供奉孔子五代先人的牌位及配享的颜回、孔伋、曾参、孟轲四位先哲之父的牌位。东西配殿坐落在砖石台基上，面阔三间，进深五檩，单檐悬山顶，内奉程颐、程颢兄弟、张载、蔡沈、周敦颐、朱熹6位先儒之父。
北京孔庙和国子监博物馆藏品
清代十三经碑孔庙和国子监博物馆有文物2000余件（套）主要包括：石器、石刻：元、明、清三代《进士题名碑》，明正统九年至道光九年《碑亭》，康熙五十四年制《编磬》，乾隆六十年刻立《十三经》碑碣，乾隆年刻制《周秦石鼓》等
青铜器：乐器，康熙五十四年制《八卦流金编钟》，乾隆年制《镈钟》；食器，乾隆年制豆、簠、簋、铏；酒器，乾隆年制爵、尊；杂项，香炉、蜡台、香挡、镜、钱、庙灯等。
铁器：香炉、蜡台。
瓷器：光绪年制盘、碗、豆、尊、爵、壶。
竹器：笾、篚。
木器：顺治至宣统年制，木匾、木豆、木簠、木簋等；康熙至乾隆年制乐器，古琴、瑟、敔、柷等。
玉器：乾隆年制，碧玉描金龙文特磬。